故事发生于“龙珠Z”10年后的世界。

这部作品的故事大纲并不是鸟山明本人的原创，但是得到集英社授权，东映动画公司由此播放了继《龙珠》、《龙珠Z》以后的第三部《龙珠GT》。鸟山明收到东映动画的故事大纲，提了些修改建议，画了些人物设定和插图，且非常推崇本片，并作为龙珠主线的最终完结篇。

贝比篇

早于天神和魔王分体前，创造了七粒黑星龙珠。许愿后的黑星七龙珠会散布于宇宙各处，要是一年内无法集齐七粒龙珠在一起的话，最初许愿的星球便会被毁灭。

七龙珠篇开始找寻七龙珠的皮拉夫找到了黑星七龙珠，在许愿时误会地许了使悟空变回小孩子的愿望。悟空和特兰克斯、孙女小芳一同找寻七龙珠以拯救地球。在找寻七龙珠出现了缪博士制作的贝比，是能够附身在人身上并吸收能力，由于附身在最强的赛亚人——贝吉塔身上，所以实力强得要悟空变身为超级赛亚人4才可打败他。

超级十七号篇

米鸟博士死后，在地狱遇到了设计人造人的格罗博士。二人制造了究极人造人超十七号，并打开了地狱往地球之门，与身在地球的人造人十七号融合成超级十七号。其他七龙珠战士与他不敌，即使变身成超级赛亚人四的悟空仍处于劣势。最后十八号扰乱十七号，悟空以龙拳及超级龟波气功才消灭了他。

邪恶龙篇

超十七号篇后，悟空等人打算找寻七龙珠让地球复原，但这次却呼唤了邪恶龙。原来由七龙珠开始七龙珠使用了太多，让七龙珠变坏。悟空自告奋勇去打倒七条邪恶龙去恢复地球。一星龙被打败后，所有负能量都得以净化。神龙在大战后突然出现，把地球恢复面貌后便带同悟空离开。七龙珠在接近一百年后才再次出现！