学院下设学院办公室、教学研究与质量管理部、教学部、教务部、招生与就业指导部、学生工作部、国际交流与培训部、资源与技术部等机构。

华中科技大学学科齐全，结构合理，有哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12大学科门类。设有本科专业94个，硕士学位授权点214个，博士学位授权点175个，博士后科研流动站35个。现有一级学科国家重点学科7个，二级学科国家重点学科15个（内科学、外科学按三级），国家重点（培育）学科7个。建有一批高水平的研究中心，有武汉光电国家实验室（筹）、脉冲强磁场实验装置等国家重大科技基础设施，还拥有5个国家重点实验室、1个国防科技重点实验室、6个国家工程（技术）研究中心、1个国家工程实验室、2个国家专业实验室及一批省部级研究基地。